rnaimmunoprecipitation、rnaisoform

图片来源：Plos Pathogens

病毒的生命周期通常通过作用于其RNA 的精确机制来协调。例如，microRNA miR-122 与丙型肝炎病毒(HCV) 的病毒RNA 基因组相互作用，并且是HCV 复制所必需的。在过去的一年里，多个研究小组报告了一种新的病毒感染RNA 调控机制，即转录后RNA 修饰N6-甲基腺苷(m6A)。这种可逆的RNA 修饰是真核RNA 60 多种已知化学修饰中最普遍的内部修饰。病毒RNA m6A 修饰的积累受到一系列机制的调节，包括甲基转移酶和去甲基酶。通过影响mRNA 和非编码RNA 的结构、定位和功能，m6A 在许多基本生物过程中发挥着重要作用。

在病毒RNA 上，RNA 修饰的存在可以阻止触发抗病毒先天免疫的宿主模式识别受体的检测。通俗地说，病毒可以逃避宿主细胞的检测和追捕。事实上，宿主也可以通过m6A修饰来增强自身的抵抗力。两项研究表明，RNA 的体外m6A 修饰可通过已知的RNA 感应模式识别受体TLR3 和RIG-I（改善先天免疫激活）增强人体自身的先天免疫机制。

病毒感染引起宿主转录组和蛋白质组的广泛变化。因此，病毒感染也会改变宿主细胞中的m6A 表观转录组也就不足为奇了。具体而言，在病毒感染期间，mRNA 5'UTR A 中的m6A 水平增加，而3'UTR 区域中的m6A 修饰减少。 5'UTR 区域的m6A 修饰在热休克过程中增加了热休克蛋白mRNA，从而促进了这些mRNA 的翻译。有趣的是，许多m6A 还可以改变病毒感染期间转录依赖性病毒复制和免疫反应。因此，m6A可以修饰特定的mRNA，从而使病毒感染更容易发生，或者可以增强宿主对病毒感染的抵抗力，从而实现额外一层的基因表达调控。

作为RNA 功能的重要转录后调节因子，m6A 和其他RNA 修饰可以调节所有类型病毒的感染。近年来的科学技术进步为系统地探索m6A在病毒感染过程中的作用以及许多相关的悬而未决的问题奠定了基础。展望未来，干扰宿主m6A机制和突变病毒RNA中的m6A机制将成为研究m6A对病毒RNA结构、定位、剪接、稳定性、翻译和免疫逃避功能的重要技术。此外，了解病毒或宿主诱导的细胞m6A 表观转录组变化对于了解病毒感染期间的基因调控至关重要。事实上，对于许多基本生物系统来说，病毒感染可能被证明是了解m6A 如何影响细胞RNA 表达和功能的有用模型。因此，我们预计病毒学及其令人兴奋的发现将成为m6A 修饰RNA 研究的核心。

原始来源：Nandan S.Gokhale、Stacy M. Horner。 RNA 修饰病毒式传播。 13（3），2017。

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