南通大学肿瘤学、南通大学肿瘤医院
基因组水平的变化是肿瘤发生、发展的重要始动因素。对此，南通大学医学院本科生团队最近自主研发了高效DNA调控元件和超级增强子筛选平台——SPACE，有助于发现新的DNA调控元件，从而调控肿瘤的分子机制，提供潜在的可能。肿瘤精准诊断和治疗的新方法。该成果近期发表于《中国免疫学杂志》（英文版）。研究发现，肿瘤的大部分基因组变化发生在非编码DNA中。揭示非编码DNA在肿瘤中的作用将有助于了解肿瘤的发生和发展，进而制定有效的肿瘤诊断和治疗策略。然而，由于非编码DNA不编码蛋白质，虽然占基因组的98%以上，但一度被认为是“垃圾”DNA，其功能被忽视。随着研究的不断深入，人们发现非编码DNA并不是“垃圾”，而是含有大量的DNA调控元件。然而，对肿瘤中非编码DNA的认识不足，一定程度上阻碍了非编码DNA在肿瘤诊断、治疗和预防中的应用。如何系统、高效地了解这些非编码DNA在肿瘤中的功能？这是当前肿瘤研究领域的一个难题。为了解决这一难题，南通大学医学院本科生团队自主研发了高效DNA调控元件和超级Enhancer筛选平台——SPACE。该平台将DNA调控元件的功能状态与肿瘤基因表达谱和预后等临床数据关联起来，使研究人员能够快速发现潜在重要的DNA调控元件。该平台包含562,709个DNA调控元件，可以快速、准确地获得候选DNA调控元件与基因表达、患者预后等参数之间的相关性，并可以识别重要的DNA调控元件。通过该平台的筛选，可以发现大量可以预测肿瘤患者预后的DNA调控元件。 SPACE平台不仅有助于发现新的DNA调控元件、对各种下游调控机制进行分析，还有助于阐明重要非编码DNA的功能和调控肿瘤的分子机制，为精准调控提供深入理解。基因和肿瘤。体内关键基因的异常激活为肿瘤的精准诊断和治疗提供了新思路，也提供了新方法。
